Rundt årsskiftet 2008/2009 økte kritikken mot den sittende presidenten Marc Ravalomanana. Opposisjonen, ledet av hovedstadens ordfører Andry Rajoelina, anklaget Ravalomanana for misbruk av offentlige midler og for å undergrave det demokratiske systemet. Etter flere måneder med protester og demonstrasjoner overgav president Marc Ravalomanana makten til det militære den 17. mars 2009. Makten ble samme dag videreført til Andry Rajoelina som opprettet et overgangsstyre bestående av hans egne tilhengere.
I etterkant av maktovertakelsen ble det opprettet en internasjonal kontaktgruppe for Madagaskar med ansvar for å bistå i forhandlingene mot en løsning på den politiske krisen. Meglerne har forholdt seg til fire politiske grupperinger, ledet av henholdsvis Andry Rajoelina, presidenten for overgangsstyret, den valgte presidenten Marc Ravalomanana, som bor i eksil i Sør-Afrika, ekspresident Didier Ratsiraka, som bor i eksil i Frankrike, og ekspresident Zafy Albert.
Etter at en lyktes å få samlet de fire fraksjoner til to forhandlingsmøter i Maputo i august/september 2009, syntes en løsning å være i sikte. Ulike parter stilte imidlertid i etterkant spørsmål ved flere av punktene fra Maputo-avtalene, og tolkningen av deler av avtalen varierte svært fra fraksjon til fraksjon. Etter nye forhandlinger i Addis Abeba i begynnelsen av november 2009 kom allikevel partene frem til enighet om organiseringen av overgangsstyret. Det viste seg imidlertid raskt at samarbeidet mellom de fire bevegelsene var vanskelig. Særlig var det problemer knyttet til fordelingen av ansvaret for de ulike ministeriene.
I begynnelsen av desember innkalte det internasjonale meglingsteamet til forhandlinger i Maputo, men Rajoelinas bevegelse ønsket ikke å delta i disse. Etter at de tre øvrige bevegelsene gjennomførte forhandlingene uten deres tilstedeværelse erklærte Rajoelina at det ikke lenger var mulig for ham å samarbeide med de øvrige bevegelsene. Like før jul 2009 erklærte således Rajoelina at avtalene fra Maputo og Addis Abeba ikke lenger var gjeldende. Han erklærte videre at den sittende overgangsregjeringen ville bli sittende i tiden fremover og at det vil bli holdt parlamentsvalg 20. mars 2010, datoen for valget er senere blitt forkøvet. Det internasjonale samfunnet har tatt avstand fra Rajoelinas unilaterale handling og oppfordrer alle de fire bevegelsene til å samarbeide innenfor rammene gitt i avtalene fra Maputo og Addis Abeba.